被帝国星人雷奥尼克斯打败并毁掉格斗仪的美菲拉斯星人雷奥尼克斯无助地漂泊着，突然发现了一把插于地上的纯黑色的剑，拔剑，穿上铠甲，他变成了暗黑美菲拉斯。另一方面，在初次见到镖形物体的时候已经疑心的隐岐终于确认那是赛文奥特曼的头镖，这一结果震惊了众人。此时，头镖发出光芒呼唤雷。顺着呼唤的指引，盘龙号进发的途中遇到了暗黑美菲拉斯并被击落。